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文档介绍

GenBankOverview基本信息什么是GenBank?GenBank是一个有来自于70,000多种生物的核苷酸序列的数据库。每条纪录都有编码区(CDS特征的注释,还包括氨基酸的翻译。GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织,包括EMBL和DDBJ纪录样本-关于GenBank的各个字段的详细描述,以及同Entrez搜索字段的交叉索引。访问GenBank-通过EntrezNucleotides来查询。用accessionnumber,作者姓名,物种,基因/蛋白名字,还有许多其他的文本术语来查询。关于Entrez更多的信息请看下文。用BLAST来在GenBank和其他数据库中进行序列相似搜索。用E-mail来访问Entrez和BLAST可以通过Query和BLAST服务器。另外一种选择是可以用FTP下载整个的GenBank和更新数据。增长统计-参见公布通知的2.2.6(每个分类的统计),227(每个物种的统计),228(GenBank增长)小节。公布通知,最新-最近和即将有的变化,GenBank的分类,数据增长统计,GenBank的引用。公布通知,旧-同上相同,是过去公布的统计。*(向)遗传密码-15个遗传密码的概要。用来确保GenBank*(向)GenBank提交(数据)关于提交序列数据,收到accessionnumber,和对纪录作更新的一般信息。BankIt-用于一条或者少数条提交的基于WW的提交工具软件。(请在提交前用VecScreen去除载体)Sequin-提交软件程序,用于一条或者很多条的提交,长序列,完整基因组,alignments,人群/种系/突变研究的提交。可以独立使用,或者用基于TCP/IP的“networkaware”模式,可以链接到其他NCBI的资源和软件比如Entrez和PowerBLAST(请在提交前用VecScreen去除载体)ESTs-

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