以EP300为中心的胰腺癌相关蛋白质相互作用网络特征分析.pdf

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文档介绍

外科理论与实践 2015 年第 20 卷第 5 期 429 · · 论著 · · 以 EP300 为中心的胰腺癌相关蛋白质 相互作用网络特征分析 马 丁 , 林大伟 * , 杨卫平 , 程 兮 , 汪炳瑞 , 沈柏用 , 彭承宏 , 邱伟华 (上海交通大学医学院附属瑞金医院外科 上海消化外科研究所 ,上海 200025 ) 摘要 目的 查找生物信息平台的胰腺癌相关基因 蛋白质调控网络以及生物通道功能注释信息数据 建立胰 [ ] : 、 , 腺 癌 转 移 相 关 蛋 白 质 相 互 作 用 网 络 。 方 法 :筛 选 GEO 数 据 库 中 获 取 的 3 组 基 因 表 达 谱 芯 片 (编 号 GSE22780 、 GSE22973 、GSE14245 ),分为正常组和胰腺癌组 ,利用倍数变化分析得到胰腺癌阶段的差异表达基因集 ,再将基因集 投射到蛋白质相互作用数据 ,得到相应的蛋白质网络 ,取相对独立 、相互作用较集中且与转移密切相关的蛋白质子 网络进行功能富集分析 。 结果 :建立胰腺癌发生发展过程中的蛋白质相互作用网络 ,分析与转移密切相关的蛋白质 子网络 ,得到以 EP300 为中心的胰腺癌相关蛋白质相互作用网络 。 结论 :本研究利用生物信息平台的胰腺癌相关基 因和蛋白质数据 ,建立以 EP300 为中心的胰腺癌相关蛋白质相互作用网络 ,为胰腺癌研究提供信息 ,可用于寻找胰 腺癌的诊治靶点 。 关键词 :生物信息学 ; 数据库 ; 蛋白质组学 ; 肿瘤转移 ; 胰腺癌 中图分类号 : 文献识别码 : 文章编号 : ( ) R735.9 A 1007-9610 2015 05-0429-05 DOI:10.16139/j.1007-9610.2015.05.015 Analysis of protein interaction networks related

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