(第四讲上)NCBI深度利用_Gene功能注释数据库的查询实践.pdf

其明生物信息 National Center for Biotechnology Information 数据库深度利用 —Gene基本信息查询与实践

李奇

研发部经理

目的 为课题设计提供指引 为研究结果的论证提供证据 为论文撰写提供思想

课程框架 基本信息门户网站 组织特异性基因表达 基因功能分类 基因参与的信号通路 基本信息门户网站

其明

信息

其明信息公司实验室主管罗燕青

其明信息公司北方区经理李林

其明信息公司服务部项目管理工程师 孙之翰

其明信息公司开发部开发工程师张永强

 比较基因组

基因功能简要描述

基因在基因组内的定位

基因转录产物种类

基因结构变异浏览——有论文验证的

基因功能代表性论文

基因变异与疾病关联代表性文献

基因参与的信号通路—

—Biosystem成分

基因功能分类描述 IDA/IMP/IPI

为实验证实的描述

基因表达的各种转录本：

不同的转录本为 同一个基因的不同蛋白产物 组织特异性基因表达

其明

信息

组织特异性基因表达

同一基因不同物种同源性 疾病类型

组织类型

Affymetrix 芯片探针 基因差异表达特点 实验设计方法 基因参与的信号通路分析方法

其明

信息

信号调控网络

信号通路间的激活模式

Path-Net样式

 以Pathway为搜索词

KEGG的功能分类角度 Metabolism Genetic Information Processing Environmental Information Processing Cellular Processes Human Disease Drug Development 上海其明信息技术有限公司 Genminix Informatics Ltd.,Co

不同的物种