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文档介绍

利用 Field-SEA 研究不同离子溶剂化自由能; 目 录

一、研究背景

二、模型介绍

三、计算步骤

四、结果与讨论

五、后续工作;溶剂化自由能;传统方法;;半显性装配(Semi-explicit assembly, SEA) 先对不同 Lennard - Jones 小球周围的TIP3P水进行预计算;

之后积累溶质分子整个区域的交互作用;— — 一种精确高效的计算模型;?;分子表面&能量场:从显式溶剂模拟提取信息;建立自由能轮廓,并进行热力学整合;建立自由能轮廓,并进行热力学整合;溶质表面点的构造;表面组分求和计算溶剂化自由能;单原子离子溶剂化自由能极性部分;利用SEA计算模型;SEA参数方程的拟合;ε值在0.0781及0.25(kcal/mol)两处的拟合曲线与原曲线的对比?Gnp= 0.370863-3.038339*ε+0.05919*σ+0.264427*σ2

+0.958926*ε*σ-0.004407*σ3-0.49852*ε*σ2;ε值在0.25及0.5 (kcal/mol)两处的拟合曲线与原曲线的对比

?Gnp = -0.31309+0.088261*ε+0.282936*σ+0.243458*σ2

-0.470081*ε*σ-0.00814*σ3-0.244443*ε*σ2

?;ε值在0.5及1 (kcal/mol)两处的拟合曲线与原曲线的对比

?Gnp= -0.04883-0.1589*σ+0.291794*σ2-0.37691*ε3-0.01475*σ3-0.11854*ε2*σ-0.1904*ε*σ2

?;单原子离子溶剂化自由能非极性部分;单原子离子溶剂化自由能;后续工作;谢谢!

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