文档介绍
我们已知一群相关GENEBANK号的基因。AB072602AB180189AB072604AB072605AB072603AB180190AB066398AB066399AB180192EF434172AB081512AB081513AB081514请构建NJ树并分析。第一步：根据以上步骤，找出相应的13个GENEBANK的FASTA格式的序列，并保存在文本里。安装并打开MEGA软件。点击Align-OK-DNA按钮。导入已经找到的序列txt文本。选中所有序列，点击Alignment-AlignbyClustalW.设置参数，点击OK，比对结果如下：点击Data-ExitAlignmentExploer。保存对比文件，保存名称为MHC-DRBALN,重新进入MEGA软件，点击Plylogeny-ML树构建,导入MHC-DRBALN。根据实际情况选择相应的计算模式和其它参数的设置，然后点击Computer。计算中。点击Bootstrap值进行位置修改，修改进化树的宽度、分枝长度、各分类单元之间的间距等。点击Caption，将显示进化树所有的参数内容。内容如下：Figure.MolecularPhylogeneticanaylsisbyMaximumLikelihoodmethod?TheevolutionaryhistorywasinferredbyusingtheMaximumLikelihoodmethodbasedontheKimura2-parametermodel[1].Thebootstrapconsensustreeinferredfrom1000replicates[2]istakentorepresenttheevolutionaryhistoryofthetaxaanalyzed[2].Branchescorrespondingtopartitionsre