华大基因 测序技术基础原理.ppt

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文档介绍

Sanger测序技术原理 第二代测序技术原理 第三代测序技术原理 第二代测序技术小结 454测序仪: 454测序仪使用的方法,经微乳液PCR发扩增后,携带有大量模板分子的微珠被放置到芯片上的微孔中。随后使用焦磷酸法测序,每一轮测序反应都会掺入一个核苷酸,随后加入反应试剂荧光素和腺苷酰硫酸。这样在每一个小孔中每当有聚合酶将核苷酸掺入到模板上都会发光。最后用腺苷三磷酸双磷酸酶洗涤去掉多余的核苷酸。 (对重复序列如poly A的测定不准确,因荧光信号具有累加效果) Solexa测序仪:Solexa测序仪使用桥式PCR直接在芯片进行模板扩增,然后同时加入四种经过修饰的脱氧核苷酸,每一个核苷酸都携带一种荧光集团和一个可被去除的终止基团。经过修饰的DNA聚合酶催化引物延伸测序反应。采集图像、然后切除荧光标记基团和终止基团,重复上述反应,完成测序。(边合成边测序) Solid测序仪:Solid测序仪使用微乳液PCR法扩增模板片段,然后吸附有大量扩增片段的直径1um的磁珠倍制成高密度测序芯片,借助使用连接酶而不是聚合酶测序法完成测序。在solid测序一中,每一次反应都会在引物末端加上一个荧光标记的8bp的探针,在探针中央的两个碱基上标记有荧光基团,探针被连接上之后发出荧光,随后荧光基团部分被切除,重新系下一轮反应。(边连接边测序) Current popular sequencing platform 斯坦福大学的科学家最近利用Helicos Biosciences的Heliscope单分子测序仪,对一名白人男子的基因组进行了测序,文章发表在最新一期的《Nature Biotechnology》在线版上。利用一台Heliscope测序仪和4次数据收集运行,完成了此次测序。 研究人员报告称,他们产生了数十亿个Heliscope序列读取,覆盖了90%的人参考基因组,覆盖度达28倍。序列读长为2

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